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Cluster: K-means¶
r.kmeans esegue una partitioning clustering K-means.
Argomenti: [1]
- varlist: l’elenco delle variabili da utilizzare nell’analisi
- Determinazione del numero di cluster:
- :method => :silhouette|:wss|:gap_stat: il metodo di stima del numero ottimale di cluster (default: :gap_sta)
- :kmax => num: il numero massimo di cluster da considerare (default: 10)
- :nboot => num: il numero di Monte Carlo samples per il calcolo della statistica gap (default: 100)
- Clustering:
- :k => num|:auto: il numero di cluster da generare oppure :auto per determinare il numero dei cluster in base al metodo :silhouette (default: :auto)
- :centers => [[], [], ...]: l’array dei centri dei cluster come array dei valori di ciascuna variabile su ogni cluster
- :nstart => num: il numero di partizioni iniziali random tra cui viene scelta quella con la più bassa varianza all’interno del cluster (default: 25)
- :scale => true|false: se standardizzare o meno le variabili (default: true)
- :cluster => name: il nome della variabile cluster
Tabelle disponibili:
- :analysis: riepilogo dei parametri dell’analisi
- :clus: la distribuzione dei cluster
- :squares: scarti quadratici medi all’interno dei cluster e tra i cluster
- :centers: i centri (medie) degli scarti
- :descrv: la descrizione dei cluster in base alle variabili originarie
Grafici disponibili:
- :dist: la matrice di dissimilarità
- :nclu: il numero ottimale di cluster
- :fctmap: i cluster plottati sul piano delle prime due componenti principali
- :heatmap: heat map dei centri dei cluster
Metodi dell’oggetto restituito:
- centers(false|true): restituisce i centri dei cluster:
- true: come hash con i nomi delle variabili
- false: senza i nomi delle variabili come array di array di ciascun cluster (default)
1 2 | model = [:murder, :assault, :urbanpop, :rape]
r.kmeans model, :rownames => :state, :k => :auto, :palette => 12
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Note
[1] | MacQueen, J. (1967) Some methods for classification and analysis of multivariate observations. Proceedings of the Fifth Berkeley Symposium on Mathematical Statistics and Probability, Volume 1: Statistics, 281-297, University of California Press, Berkeley, Calif. https://projecteuclid.org/euclid.bsmsp/1200512992 |
[2] | Consultare Analisi per l’elenco dei parametri generali. |